CDS
Accession Number | TCMCG066C06267 |
gbkey | CDS |
Protein Id | XP_034582419.1 |
Location | complement(join(20509997..20510099,20510204..20510310,20510455..20510594,20510687..20510912,20511030..20511110,20511193..20511339,20511426..20512530,20513421..20513713,20513796..20514061,20514216..20514414,20515009..20515323,20515423..20517203,20517300..20523273,20523419..20523625,20523712..20523807,20525138..20525170)) |
Gene | LOC117845479 |
GeneID | 117845479 |
Organism | Setaria viridis |
Protein
Length | 3690aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA633601 |
db_source | XM_034726528.1 |
Definition | E3 ubiquitin-protein ligase UPL1-like isoform X3 [Setaria viridis] |
EGGNOG-MAPPER Annotation
Sequence
CDS: ATGAAGCTCAAGCGGCGACGCGCGGTGGAAGTGCCTCCAAATATAAAATCTTTCATCGACAGTGTTACCGCAGTTCCTCTTGACAATGTAGAACTGCCTCTGAAGGATTTTGCATGGGAATTTGACAAGGGGGATTTTCATCACTGGGTGGACCTTTTCAATCACTTTGATTCTTTCTTTGAGAGTTATATCAAATCAAGGAAAGATTTGCTGCTCGAAGATAATTTTCTTGATGTGGATCCCCCATTTCCTAGGGAAGCAGTCCTTCAAATTCTTCGAGTGTCAAGAATAATATTGGAAAATTGCACAAATAGACACTTCTATAGTTTTTTTGAGCAGCATCTGTCTGCTCTTCTAGCATCTACAGATGCGGATATTGTTGAAGCGAGCTTGCAGACATTAATGGCATTTGTAAACAAGTCAGTTGGGAAAAGCTCGATACGCAGCACATCTCTGACTTCAAAGTTATTTGCCTTCTCTCAAGGTTGGGGTGGAAAAGAAGGCGGCCTTGGATTAATAGCATGTTCTTTGCCGATTGTATCGGATCCAGTTTCCACTGAAGTTGGCTCCACTCTCCATTTTGAGTTCTATCGTGGTGCTGATAAATCAGAGAAATCCCAGTCTGTAGATAAGGGGAACAGGTTGGAAGTAATTCATTTACCGAATGTCAATACCTGCAAGGAGACAGACCTTGAAATATTGGACAAGTTGGTCAAGGATTACAGTGTGCCGCAAGCTTTAAGGTTCCCTCTTCTTACAAGATTGAGATTTGCAAGGGCATTTGACACTTTGACATGTCGACGCCAATATATCTGTATCCGCCTATATGCCTTTATTGTTCTTGTGCAAGCAGGCCATGATACTGAAGGTTTATCATCATTTTTGAATAATGAACCAGAATTCATTGATGAGCTATTATCATTGCTTAGCTACGAGGATGAGATACCAGAAAAAATTAGGATATTGGGAATCCTTTCATTGGTTGCACTGTCCCAAGATCGATCTCACCAGCCTACTGTATTGTCCTCGGTAACTTCAGGTGGTCATCGTAGTATTCTTCCTAGTCTCATGCAGAAGGCAGTTGATTCTATCATCAGTGGTTCTATGAAATGGTCCATAATATTTGCTGAAGCTCTTCTTTCTCTTGTTTCTATGTTGGTATCATCAACCCCAGGTTCTCTAGCTCTTCAAGAAGCAGGTTTTATACCCACCATTTTGCCTCTTCTCAAAGATACAAACACACAGCATTTACACCTTGTTAGTACGGCAGTGCATGTCATTGAGAGCTTCCTGGATTATCACAATCCCTCTTCAGCATTGTTCAGGGATCTAGGTGGACTAGATGACACTATTGCACGCCTTAAGATAGAAGTATCACAAGTTGAGATTGGTTCGAAAAAAAATGAAGAGTCTCAGTCAATCAATAAAGGAAAAGAGGTTGAAAGTTGTCCACTGGTGCCAGATATGCAGCCCTCATGTTCTGAAGCCTTGGTTTTGTATAATAGGAAGAACTTAATGAAAGTTTTACTACGTACAATATCTCTGGCAACATATGTTCCTGGTAGCTCTGCTCGTGTTGATGGTTCTGAAGAGAATGTATTGCCTCCATGTTTATGTACAATTTTTAGGAGAGGCAAGGACTTTGGTGGTGGTGTTTTCTCACTTGCTGCAAATGTTATGAGTGATCTCATACATAAAGACCCAACATGCTATTCTGTTCTTGATGCAGCTGGTTTGCCACAAGCATTTCTTGATGCTATACTGGACGGTGTACTTTACAACTCTGATGCAGTCTCATGTATACCACAGTGTTTGGATGCATTATGTTTGAATAATAGTGGTCTTCAATTAGTAAAGGACTGCAATGCTTTAAGATGCTTTGTGAAAATCTTTACCTCCAGATTATATTTGAAGGCTCTTAATGGGGACACAACAGGGGCCTTATCAAGTGGACTCGATGAATTAATGCGCCATGCATCATCATTACGTTCCTCTGGAGTTGACATGTTTATTGAAATCTTGAACACTGTTTCAAAAATTGGGTGTGGTGGAGACTCTAATTCCTGTGCGGAATGTGATAATTCCTCTGCAGCTGTTCCCATGGATGCTGATGTGGAGGGAGCTACAACACAGAGTGAGGGTGTACCTTCTGAGGTGGGATGCTCAGGCAAAATGGTTGAGGCTCCTCTAGATGCTACGACATCATCTTCCATTGAGTTATTTCTTCCTGAATGCATATGCAATGTTGCTCGTCTCCTTGAAACTGTTCTGCAAAATACTGACACATGCAGGCTATTCATTGAGAAAAAAGGAATTGAAGCTGTTCTTCAACTGTTTAAGTTGCCAGTATTACCTGTATCTGTTTCAATTGGTCAGAGTATTTCTGTTGCATTTAAAAACTTCTCACCTCAGCATTCTGTTTCTCTGGCAAGAGCAGTGTGCTCATTTTTTCGAGACCACCTTAAATTGACAAATGAACTGTTGGGTTTGATCTCTGGAACTAAGCTGGTTGATAGTGAACTTGTGAAGCAATCAGCTCTCATGAAATCACTTTCTACTCTTGAAGGGCTTTTATCTCTTGCCAATTTTCTTCTAAAGGGAACAACCATTATGATTTCAGAACTGGCTTTTGCAGATGCTGAGATATTGAAGGAATTGGGGAAGGTTTATACTGAAGTCACATGGCAGATCTCTTTACTCAGTGATGCCAAGGTGGATAAGCAAGAGTCAGATCAAGATGATGTAGCTGGAGATGCTTCAATTTCTAATGCATCTGAAAGGGATAGTGATGATGACACAAGTGCAGCACCAGTAGCAAGATATATGAATTCTGTTTCAGCAAGAGCCTCTTTATCACCCTGGAGCATGGAGCAAGATTTTGTATCAGCAGTCCGATCTGCTGCCAACATGCACCGCCATGGTCGGCACTCACTATCAAGGATACGTGGGCGCCTAAGTGGAGTATTGGATGCAACACATACTGATTTGGATGGCCCTTTTTCTCCAGCAGAGATCTCTAGGAGTCATGATGCTTCAAAGAAAAGTCCTGAAGTTGTTGTTTCTGAACTTCTGACAAAGCTTGGCTACACCATGCGTTCCTTCCTCTCTACCCTTGTCAAAGGATTACCAGCTCGTCGTCGAGCTGACTCTAATCTTAGCCCAGCTTCAAGAAGTCTTGTGACTGCACTTGCACAACTTTTCCTTAGCGCTCTTGGTTACTCTGGACATTCTACCGCTGGCTTTGAGATGTCGTTATCTGTCAAATGTCGATACCTTGGAAAGGTTGTGGAAGACATGGCTGTGCTTACATTCGACAGCAGGCGTCGCTCATGCAATTCTGCACTTGTTAATAGTTTCTATGTGAATGGAACGTTCAAGGAAGTTCTAACTACCTTTGAAGCCACCAGTCAGCTTCTATGGACGCTTCCTTTCTCTGCTCCTGCTGGCACAGATCAAGGTTCCTCTATTAATGAGAAGGTGTCTCACAATACCTGGCTTCTGGATACGTTGCAGAGTTATTGTAAATTGCTAGAATATTATGTGAACTCTACATTCTTATTGTCTCCATCCTCTTCTCATAATCAGCTTCTTGTCCAGCCTATTGTTACTGAGCTGTCAATTAATCTATTCCCCGTGCCTTCAGAGCCAGAATCATTTGTTCGTATGCTTCAATCTCAAATTCTAGACGCAGTCCTTCCTGTTTGGAATCATAAAATATTTCCTGAGTGCAGCCCAACTCTTGTTACCTCCTTGGTCTCAATTATGAACAATATATGCTCTGCTGTTGGAGATCTGAAGCAAAGCCGCAATATTGCCGGGGTTGCCAACCAGCGTGTTACTAGCCCCCCTCTTGATGAGTCAGCTATTGCTACGATTGTTGAAATGGGATTTTCAAGAGCTAGGGCAGAAGAAGCTCTGAGAAGCGTCAGAACTAACAGCGTGGAGATGGCAACTGATTGGTTGTTCAGCCATCCAGAAGAATTTGTTCAAGAAGATGTGCAGCTTGCACAGGCACTAGCTTTGTCACTTGGAAACTCCATTGAAACACCCAAGGAGGATGGAAGCAATAAGAATGATACAGCTACTGCTGAAGAAAAAGGTGTATTTGTGCTCCCTTTGGATGACATTCTCACTGTATCGACAAAGCTTTTCTGCTCTAGTGATTCCGCCATGGCTTTCCCATTGACTGACCTTCTAGTGACACTATGCAACCGTAATAAGGGGGAATACCGACAGCGGGTAGTCCTGTATCTTTTTGAGCAACTAAGACGTTTTTCGTCAGATACCATCACTGATGCAGGTGCTTTGTATTCCGTTGCCCATTTGTTGGCTTTGCTTCTGAGTGAAGACAGTGGCATACGTGAAATTGGTGCTGAAAATGGTGTCACCCCTCACGTTCTTAACATGTTAGAAAATCTTAAATCAAGGACAGACCACACAGATAAGACTTGGAATTCTATCAGTGCTCTGTTGCTCATATTGGATAACATGCTACAATTTAATCCAAAGCTTAATACGGAAACAACAGATGGTGCATCCAAGTCAACTTCTGACATATCCAGTGCTGACAGCAAGGCAAATCCAGCACCACCTGATGAAGAGAAAACTGAAACTATGGATTCAGCAGACGATGCAAGTGCTAATGTGTTTGAAAAGATTTTGGGGAAATCTACTGGCTATTTGACCGATCAGGAGAGCCAAAAGGCACTGGTTTTCTGCTGTGAATTCATCAAGAAACGTGTGCCAGCAACAGTTATGCAAGCTGTTCTTCAGCTCAGTGCCCGCTTGACAAAGACACATGCTCTTGCTGCTCAATTTTTTGAAAATGGTGGCCTATCATCTCTTTTAAATCTCCCAAGTGCTTGCATCTTTCCAGGATTTGAGACCTTAGCATCTGCCATTGTGCGCCACCTCATTGAGGATCCTCAGACCTTGCAGAGTGCCATGGAATTGGAGATACGACAGTCATTAAGCAACCGTGGCAGTCGTACTCCACGCTC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